福州市疾病预防控制中心（福州市卫生健康监督所）前身为福州市卫生防疫站，成立于1952年7月，是全国首批甲级防疫站，2003年12月更名为福州市疾病预防控制中心。2023年11月，整合原福州市疾病预防控制中心与市卫生计生监督所，组建福州市疾病预防控制中心（福州市卫生健康监督所），为公益一类事业单位，主要职责涵盖疾病监测防控、突发公共卫生事件应急处置、卫生健康监督执法、消毒与病媒生物防控、健康危害因素监测评价、实验室检测分析、健康教育与促进等。

　　中心核定内设机构22个、编制331人，现在编213人，其中博士4人、硕士50人、高级职称50人。现有各类仪器设备超过1500台件，总价值超过1.2亿元，拥有基因测序仪、ICP-MS超高效液相色谱仪、液相色谱-质谱仪、气相色谱-质谱仪等一大批先进仪器设备，是国家致病菌识别网络实验室、流感网络监测实验室、艾滋病确证实验室、结核参比实验室等。获检验检测机构资质认定、放射卫生技术服务机构等资质。中心作为福建医科大学附属疾控中心、硕士培养基地及多所高校教学实习基地，承担国家863计划项目、国家自然基金项目、省自然科学基金、省卫健委重大科研专项等项目50余项，发表SCI学术论文近30篇。

　　中心全面贯彻“预防为主”工作方针，秉持“崇德 勇毅 精进 至善”的疾控精神，创新打造“智慧疾控”，在疾病预防控制、卫生监督执法、公共卫生服务等领域不断开拓奋进，全力为市民提供全方位全周期的健康保障和服务。先后获评全国卫生计生系统先进集体、全国卫生系统抗击非典先进集体、福建省五一劳动奖状、福建省抗击新冠肺炎疫情先进集体等荣誉。